医療費控除とセルフメディケーション税制の違い｜どっちが得？計算方法と選び方

この記事のポイント

医療費控除のしくみ

国税庁のタックスアンサー（No.1120）では、医療費控除の額は次のように計算するとされています。

（その年に支払った医療費 − 保険金などで補てんされる金額）− 10万円
※その年の総所得金額等が200万円未満の人は、10万円ではなく総所得金額等の5%

セルフメディケーション税制（医療費控除の特例）は、健康の維持増進や病気の予防に取り組んでいる人が、対象の市販薬（特定一般用医薬品等）を買った場合に使える制度です（国税庁 No.1129）。

（対象の市販薬の購入費 − 保険金などで補てんされる金額）− 1万2,000円（上限8万8,000円）

こんな人	向いている制度
入院・手術・通院・出産などで、家族の医療費が年10万円を大きく超えた	医療費控除
病院にはあまり行かないが、対象の市販薬を年1万2,000円を超えて買った	セルフメディケーション税制
どちらも使える	両方の控除額を計算して、大きいほうを選ぶ

2つの制度は選択制で、併用はできません。一度選んだ後に、更正の請求や修正申告で別の制度に変えることもできません（国税庁 No.1129）。

確定申告の全体の流れは確定申告の流れで解説しています。医療費控除のために確定申告をする人で、ふるさと納税のワンストップ特例を申請している場合は、寄附も確定申告に含める必要があります（ふるさと納税と確定申告）。

この記事は 2026年10月時点の国税庁タックスアンサー（令和8年4月1日現在法令等）にもとづく一般的な解説です。対象になる医療費や医薬品は国税庁のページでご確認ください。